Office VSTO插件user.config文件夹重建、设置丢失原因咨询

我开发的WinForm应用（当前为Office VSTO插件）通过.NET Framework自动将运行时用户设置保存至app data文件夹的user.config文件中。近期客户反馈应用设置丢失，经查发现存储user.config的文件夹被重建，原文件被删除，应用转而使用新生成的文件夹。用户表示未重装应用（该情况无法确认），请问此现象产生的原因是什么？是否有可能是Windows（或Office更新）导致应用被重装？

• 程序集核心信息变更：.NET Framework的用户设置系统是根据应用的程序集版本、公钥令牌、签名证书这些核心信息生成user.config的存储路径的。哪怕只是插件更新时改了版本号、换了签名证书，系统都会判定这是个“新应用”，直接创建新的配置文件夹，旧配置自然就找不到了——这种情况在版本迭代时很容易出现，哪怕是小版本号变动。
• Windows/Office更新的间接影响：Windows的功能更新、Office的重大更新，可能会对VSTO插件做兼容性修复或重置操作。比如Office更新会重新注册插件，让.NET Framework误以为应用部署信息变了；或者Windows更新清理了旧的应用缓存目录，间接触发配置文件夹重建。
• 用户配置文件异常：如果用户的Windows个人配置文件夹（C:\Users\<用户名>）损坏，系统会自动生成临时配置文件，插件的user.config会被存到新的临时目录里，原配置就丢了。另外用户手动迁移配置文件、用系统工具修复配置文件，也可能引发这个问题。
• 第三方工具误清理：杀毒软件、系统优化工具可能会把user.config所在目录当成冗余缓存或可疑文件删掉。有些激进的清理工具会扫描AppData下的陌生目录，直接执行删除操作，这也会导致配置丢失。
• 插件安装路径变动：要是插件的安装目录被改动——比如用户手动移动了文件夹、Office更新调整了插件默认路径——.NET Framework会认为应用部署位置变了，进而生成新的配置文件夹，旧配置无法被识别加载。

确实存在这种可能，但不是常规意义上的用户主动重装。Windows或Office更新过程中，可能会对VSTO插件执行重新注册、修复安装这类操作，这些操作会让.NET Framework检测到应用的部署信息（比如程序集路径、注册项）发生变化，最终触发新的user.config文件夹创建，旧配置也就无法被读取了。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Dejan Dozet