如何在ggplot堆叠条形图中显式设置fill变量的顺序？

你之前误用了scale_y_discrete来设置fill的顺序——y轴是连续数值型变量（对应你的value列），这个函数只会修改y轴的显示，和fill的堆叠顺序完全无关，反而会把连续轴强制转成离散，导致轴标签异常。

要设置堆叠部分的顺序，需要针对fill对应的分类变量（也就是Name）来操作，有两种常用方法：

方法1：直接用scale_fill_discrete指定顺序 #

在绘图代码里添加scale_fill_discrete(limits = names)，它会直接控制fill图例和堆叠的顺序：

library(ggplot2)
library(reshape2)

df_dtype <- data.frame(Name = c("Jim","Bob","Sue","Sally"),
                       Pre = c(150, 200, 325, 120),
                       Post = c(70,120,200,100) )

mdtype <- melt(df_dtype)

names = c("Jim","Bob","Sue","Sally")
p <- ggplot(mdtype, aes(x=variable, y=value, fill=Name)) + 
  geom_bar(position="stack", stat="identity") + 
  ylab("Frequency") + xlab("") + ggtitle("Report Type") +
  theme(axis.ticks.x = element_blank(),axis.text.x = element_text(angle = 45, vjust = 1, hjust=1)) +
  scale_fill_discrete(limits = names) # 关键修改
p

方法2：将Name转为因子并指定levels #

提前把Name列设置为因子，指定你想要的顺序，ggplot会自动沿用这个顺序来堆叠：

library(ggplot2)
library(reshape2)

df_dtype <- data.frame(Name = c("Jim","Bob","Sue","Sally"),
                       Pre = c(150, 200, 325, 120),
                       Post = c(70,120,200,100) )

# 将Name转为因子，指定levels顺序
df_dtype$Name <- factor(df_dtype$Name, levels = c("Jim","Bob","Sue","Sally"))
mdtype <- melt(df_dtype)

p <- ggplot(mdtype, aes(x=variable, y=value, fill=Name)) + 
  geom_bar(position="stack", stat="identity") + 
  ylab("Frequency") + xlab("") + ggtitle("Report Type") +
  theme(axis.ticks.x = element_blank(),axis.text.x = element_text(angle = 45, vjust = 1, hjust=1))
p

两种方法都能让堆叠部分按照Jim→Bob→Sue→Sally的顺序排列，推荐第二种，因为它从数据层面定义了分类顺序，后续其他可视化操作也能沿用这个逻辑。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者John Conor