如何让R的devtools::install_github()读取gitcreds存储的GitHub凭证？

我正在将GitHub凭证从~/.profile迁移至正规凭证管理器（运行环境为macOS Monterey 12.6）。目前我可以通过以下代码访问私有仓库：

devtools::install_github("myname/myrepo", auth_token = "my_personal_access_token")

但我希望无需每次输入个人访问令牌（PAT）或写入脚本即可完成操作（我需要频繁切换仓库标签）。我已尝试使用：

gitcreds::gitcreds_set()

执行后显示：

-> Your current credentials for 'https://github.com':
protocol: https 
host    : github.com 
username: myname 
password: <-- hidden --> 

-> What would you like to do?
1: Abort update with error, and keep the existing credentials
2: Replace these credentials
3: See the password / token

Selection:

我选择查看密码/令牌确认其正确，但不携带PAT时执行以下代码会失败：

devtools::install_github("myname/myrepo")

报错信息：

Error: Failed to install 'myrepo' from GitHub:
  HTTP error 404.
  Not Found

  Did you spell the repo owner (`myname`) and repo name (`myrepo`) correctly?
  - If spelling is correct, check that you have the required permissions to access the repo.

我的问题是：如何让install_github()从gitcreds包中获取凭证？

以下是我的sessionInfo()供参考：

R version 4.2.1 (2022-06-23)
Platform: x86_64-apple-darwin21.6.0 (64-bit)
Running under: macOS Monterey 12.6

Matrix products: default
LAPACK: /usr/local/Cellar/r/4.2.1_4/lib/R/lib/libRlapack.dylib

locale:
[1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] gitcreds_0.1.2 devtools_2.4.4 usethis_2.1.6 

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] Rcpp_1.0.9          pillar_1.8.1        compiler_4.2.1      later_1.3.0        
 [5] urlchecker_1.0.1    prettyunits_1.1.1   profvis_0.3.7       remotes_2.4.2      
 [9] enstools_0.0.0.9000 tools_4.2.1         digest_0.6.29       pkgbuild_1.3.1     
[13] pkgload_1.3.0       tibble_3.1.8        memoise_2.0.1       lifecycle_1.0.2    
[17] pkgconfig_2.0.3     rlang_1.0.6         DBI_1.1.3           shiny_1.7.2        
[21] cli_3.4.1           rstudioapi_0.14     curl_4.3.2          fastmap_1.1.0      
[25] stringr_1.4.1       dplyr_1.0.10        generics_0.1.3      vctrs_0.4.2        
[29] fs_1.5.2            htmlwidgets_1.5.4   tidyselect_1.1.2    glue_1.6.2         
[33] R6_2.5.1            processx_3.7.0      fansi_1.0.3         sessioninfo_1.2.2  
[37] callr_3.7.2         purrr_0.3.4         magrittr_2.0.3      ps_1.7.1           
[41] promises_1.2.0.1    ellipsis_0.3.2      htmltools_0.5.3     assertthat_0.2.1   
[45] mime_0.12           xtable_1.8-4        httpuv_1.6.6        utf8_1.2.2         
[49] stringi_1.7.8       miniUI_0.1.1.1      cachem_1.0.6        crayon_1.5.2  

1. 修正gitcreds的凭证存储格式 #

devtools::install_github()依赖remotes包处理凭证，而GitHub的HTTPS验证要求用户名必须设为git（而非你的GitHub账号名）。重新设置凭证：

gitcreds::gitcreds_set(url = "https://github.com")

在交互选项中选择2替换现有凭证，然后输入：

• 用户名：git
• 密码：你的PAT

2. 配置git使用系统钥匙串 #

macOS下确保git使用系统钥匙串管理凭证，执行以下终端命令：

# 清除旧的凭证配置（如果有）
git config --global --unset credential.helper
# 设置使用osxkeychain
git config --global credential.helper osxkeychain

3. 清除残留的环境变量 #

如果之前在~/.profile中设置过GITHUB_PAT环境变量，remotes会优先读取该变量而非git凭证。检查并移除：

# 检查是否存在GITHUB_PAT
Sys.getenv("GITHUB_PAT")

如果有返回值，打开~/.profile删除相关设置，然后重启R会话。

4. 验证凭证并测试 #

确认凭证读取正确：

gitcreds::gitcreds_get(url = "https://github.com")

确保返回的用户名为git，密码为你的PAT。之后直接运行安装命令即可：

devtools::install_github("myname/myrepo")

5. 排查404错误的其他可能 #

如果仍报错，需确认：

• 仓库路径完全正确（GitHub对仓库名大小写敏感）
• PAT已勾选repo权限（在GitHub的PAT设置页面检查）
• 系统钥匙串中无旧的错误GitHub凭证，可手动删除后重新设置

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Ngwenyama