使用Pandas与Numpy读取矩阵文件时遇到格式兼容问题

你的问题出在保存文件的格式不符合原文件约定，导致read_table无法正确解析数据：

• 原文件结构：第一行是矩阵边长N，后续N行每行包含N个空格分隔的数值，无表头。
• 你用DataFrame.to_csv保存时，默认会写入DataFrame的列名（表头），且未显式指定header=None，加上read_table读取新文件时的分隔符识别逻辑混乱，最终把每行数据当成单个字符串元素，数组尺寸和预期不符。

修改保存代码，确保输出格式和原文件完全一致：

import os
from pandas import DataFrame

# 假设croptrix是裁剪后的N×N矩阵，clength为其边长
clength = croptrix.shape[0]
save_path = os.path.join(root, 'sys_crop_long.dat')

# 先写入第一行的矩阵边长
with open(save_path, 'w') as f:
    f.write(f"{clength}\n")

# 追加写入矩阵数据：无表头、无索引，空格分隔
DataFrame(croptrix).to_csv(save_path, sep=' ', index=False, header=False, mode='a')

• 原read_table能解析初始文件，是因为初始文件无表头，且read_table默认用\s+（任意空格）作为分隔符；新文件因多了表头行，打乱了解析逻辑。
• 用mode='a'追加写入矩阵数据，避免覆盖之前写入的边长行。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者QuantumDrive