为Kaplan-Meier分析修改数据框：从汇总死亡率转为个体状态

我手头有一个跨度13年的大型数据集，包含多个样地（plot）和处理组（treatment），追踪的响应变量是死亡率，目前数据是汇总格式。为了开展Kaplan-Meier分析或其他生存分析，需要把数据转成非汇总格式——也就是每行对应一个个体，需包含：个体的状态（0=存活/截尾，1=死亡）、死亡日期，以及所属的样地和处理组。

当前汇总数据的结构 #

现有数据按样地、处理组做了汇总，比如会记录某样地某处理组在特定年份的死亡个体数量、存活个体数量等信息。

期望的非汇总数据结构 #

完整格式（含截尾标记） #

每行代表一个独立个体，字段包括：

• 样地（plot）
• 处理组（treatment）
• 个体ID（可通过样地+处理组+死亡日期编码生成）
• 死亡日期（存活个体填研究周期的结束日期）
• 状态（0表示存活/截尾，1表示死亡）

简化格式 #

同样每行对应一个个体，核心字段为：

• 样地（plot）
• 处理组（treatment）
• 个体ID（按样地+处理组+死亡日期编码）
• 死亡日期（存活个体可统一标记为研究结束日期或留空）

内容的提问来源于stack exchange，提问作者chaparral