Linux系统下R语言writexl包安装失败问题求助

问题描述 #

在Linux Mint 21和Fedora 36系统的RStudio中尝试安装R语言的writexl包时失败，核心错误为编译阶段找不到zlib.h头文件，具体错误输出如下：

> install.packages("writexl")
Installing package into ‘/home/scott/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.2’
(as ‘lib’ is unspecified)
尝试获取URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/writexl_1.4.1.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 258461 bytes (252 KB)
==================================================
已下载252 KB

* 正在安装*源码*包‘writexl’ ...
** 成功解压writexl包并校验MD5和
** 使用分阶段安装
** libs
gcc -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -Iinclude -DUSE_R_LANG    -fvisibility=hidden -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-zYgbYq/r-base-4.2.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2  -c write_xlsx.c -o write_xlsx.o
gcc -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -Iinclude -DUSE_R_LANG    -fvisibility=hidden -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-zYgbYq/r-base-4.2.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2  -c libxlsxwriter/app.c -o libxlsxwriter/app.o
gcc -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -Iinclude -DUSE_R_LANG    -fvisibility=hidden -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-zYgbYq/r-base-4.2.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2  -c libxlsxwriter/format.c -o libxlsxwriter/format.o
gcc -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -Iinclude -DUSE_R_LANG    -fvisibility=hidden -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-zYgbYq/r-base-4.2.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2  -c libxlsxwriter/theme.c -o libxlsxwriter/theme.o
gcc -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -Iinclude -DUSE_R_LANG    -fvisibility=hidden -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-zYgbYq/r-base-4.2.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2  -c libxlsxwriter/chart.c -o libxlsxwriter/chart.o
gcc -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -Iinclude -DUSE_R_LANG    -fvisibility=hidden -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-zYgbYq/r-base-4.2.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2  -c libxlsxwriter/hash_table.c -o libxlsxwriter/hash_table.o
gcc -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -Iinclude -DUSE_R_LANG    -fvisibility=hidden -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-zYgbYq/r-base-4.2.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2  -c libxlsxwriter/utility.c -o libxlsxwriter/utility.o
gcc -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -Iinclude -DUSE_R_LANG    -fvisibility=hidden -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-zYgbYq/r-base-4.2.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2  -c libxlsxwriter/content_types.c -o libxlsxwriter/content_types.o
gcc -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -Iinclude -DUSE_R_LANG    -fvisibility=hidden -fpic  -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-zYgbYq/r-base-4.2.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2  -c libxlsxwriter/packager.c -o libxlsxwriter/packager.o
libxlsxwriter/packager.c:10:10: 致命错误：zlib.h：没有那个文件或目录
   10 | #include <zlib.h>
      |          ^~~~~~~~
编译终止。
make: *** [/usr/lib/R/etc/Makeconf:168: libxlsxwriter/packager.o] 错误 1
ERROR: 编译包‘writexl’失败
* 正在移除‘/home/scott/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.2/writexl’
Warning in install.packages :
  安装包‘writexl’时退出状态非零

问题原因 #

writexl依赖的libxlsxwriter库需要zlib开发包提供的zlib.h头文件进行编译，系统中未安装该依赖包导致编译失败。

解决方案 #

根据不同Linux发行版，先安装对应的zlib开发包，再重新安装writexl：

1. Linux Mint 21（Debian/Ubuntu系） #

打开终端执行以下命令安装zlib开发包：

sudo apt update && sudo apt install zlib1g-dev

2. Fedora 36（RPM系） #

打开终端执行以下命令安装zlib开发包：

sudo dnf install zlib-devel

3. 重新安装writexl包 #

依赖安装完成后，回到RStudio中执行安装命令：

install.packages("writexl")

安装成功后可通过以下命令验证：

library(writexl)

若未报错则说明安装成功。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者gaasantana