如何用rowSums筛选存在于20-29种细菌的目标基因？

问题分析 #

你需要筛选出存在于至少20种但非全部30种细菌中的基因，也就是行和（每种基因对应的细菌数量）在20~29范围内的行。之前错误使用|（逻辑或）导致条件覆盖所有行，因为>=20或<=29会包含所有可能的行和（最大行和是30，30满足>=20，其他行和都满足<=29）。

正确解决方案 #

以下几种方法都能实现需求：

方法1：基础R逻辑与运算符&

直接用&同时满足两个条件，这是最直接的写法：

commonsymbols <- cleansymbols3[rowSums(cleansymbols3) >= 20 & rowSums(cleansymbols3) <= 29, ]

方法2：使用dplyr的between函数（更直观）

如果习惯使用tidyverse语法，可以用dplyr的filter和between函数：

library(dplyr)
commonsymbols <- cleansymbols3 %>%
  filter(between(rowSums(.), 20, 29))

方法3：用%in%匹配整数序列

因为行和是整数，也可以直接匹配20:29的序列：

commonsymbols <- cleansymbols3[rowSums(cleansymbols3) %in% 20:29, ]

内容的提问来源于stack exchange，提问作者DeGeneraal