在Quarto中调用外部R脚本遇‘RStudio not running’错误求助

问题原因 #

here包默认依赖RStudio的项目上下文识别项目根目录，但Quarto渲染文档的运行环境并未加载RStudio相关上下文，因此调用here()时会触发该错误。

解决方案 #

方案1：直接使用相对路径 #

由于R脚本与Quarto文档处于同一目录，无需依赖here包，直接用相对路径调用source即可：

source("R_Functions.R")

方案2：保留here包并明确根目录 #

若需要继续使用here包，可通过i_am()函数手动指定项目根目录，确保here能正确定位文件：

library(here)
# 以当前qmd文件为锚点明确项目根目录
here::i_am("quarto_test2.qmd")
source(here("R_Functions.R"))

同时建议将工作目录配置为RStudio项目（存在.Rproj文件），能让here包更稳定地识别根路径。

验证方式 #

执行任一方案后重新渲染Quarto文档，若能成功加载R脚本内容，即说明问题已解决。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者A. Piong