为何ArgoCD未执行Kustomize资源定制反而尝试创建Kustomization资源？

原因 #

ArgoCD把kustomization.yaml当作集群资源创建的核心原因是应用配置未启用Kustomize构建模式：

• 你可能直接指定kustomization.yaml作为部署的资源文件，而非指向包含该文件的目录触发ArgoCD的Kustomize构建流程；
• ArgoCD误将kustomization.yaml识别为Kubernetes的Kustomization CRD资源（多数集群默认未安装该CRD），导致卡在资源创建环节，自然不会执行注解注入和资源生成逻辑。

解决步骤 #

1. 修正ArgoCD应用的源配置 #

UI创建应用场景

在应用创建页面的「Source」区域：

• 勾选「Directory recurse」选项；
• 「Path」填写包含kustomization.yaml的目录路径（比如./test-namespace），而非具体的kustomization.yaml文件路径；
• 确保未在「Source」的其他配置（如Helm、Jsonnet）中覆盖Kustomize处理逻辑。

YAML定义Application资源场景

修改spec.source.path指向目录而非单个文件，示例配置：

apiVersion: argoproj.io/v1alpha1
kind: Application
metadata:
  name: test-namespace-app
  namespace: argocd
spec:
  project: default
  source:
    repoURL: <你的代码仓库地址>
    targetRevision: HEAD
    path: ./test-namespace  # 指向包含kustomization.yaml的目录
  destination:
    server: https://kubernetes.default.svc
    namespace: default
  syncPolicy:
    automated:
      prune: true
      selfHeal: true

2. 清理错误同步记录 #

• 在ArgoCD UI的应用「Resources」标签中，删除状态为「Pending」的Kustomization类型资源；
• 若集群中已存在该CRD资源，用kubectl手动清理：

  kubectl delete kustomization <错误资源名> -n <对应命名空间>
  

3. 验证本地Kustomize构建正确性 #

先在本地运行命令确认配置逻辑正常：

kustomize build <你的目录路径>

输出的Namespace资源应包含argocd.argoproj.io/sync-wave: "-9999"注解，确保配置本身无语法错误。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Michael Chudinov