针对你的问题，有几个简单有效的方法来给所有MATLAB代码块加上语法高亮，完全符合你不需要运行代码的需求：

方法一：全局指定pandoc默认代码语言（最简单） #

因为你不需要运行代码，只是要语法高亮，直接让pandoc把所有未指定语言的代码块都当成MATLAB处理就好。只需要在你的Rmd文件的YAML头部添加pandoc_args配置，不管输出HTML还是PDF都适用：

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title: matlab code in blocks
output:
  html_document:
    pandoc_args: ["--default-code-language=matlab"]
  pdf_document:
    pandoc_args: ["--default-code-language=matlab"]
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这样一来，所有没有明确指定语言的Markdown代码块（不管是用```包裹还是四个空格缩进的）都会自动应用MATLAB语法高亮，完全不用修改代码块本身。

方法二：批量给代码块添加MATLAB语言标记（更精准） #

如果你的原始Markdown文件里的代码块连包裹都没有（就像你示例里那样，直接是纯文本代码行），那第一步得先把这些代码转换成标准的Markdown代码块。你可以用简单的R脚本批量处理所有文件，自动给代码块加上matlab ```的标记：

# 批量处理所有.md文件的脚本
library(stringr)

process_md <- function(file) {
  content <- readLines(file, warn = FALSE)
  in_code <- FALSE
  new_content <- c()
  
  for (line in content) {
    # 识别代码块的起始行（比如包含"code block"的行）
    if (str_detect(line, "code block [A-Z]")) {
      new_content <- c(new_content, line, "```matlab")
      in_code <- TRUE
    } 
    # 识别代码块的结束（遇到标题行或者文件结尾标记）
    else if (in_code && (str_detect(line, "^#") || str_detect(line, "^End of file"))) {
      new_content <- c(new_content, "```", line)
      in_code <- FALSE
    } 
    else {
      new_content <- c(new_content, line)
    }
  }
  # 处理文件末尾的未闭合代码块
  if (in_code) new_content <- c(new_content, "```")
  
  writeLines(new_content, file)
}

# 运行脚本处理当前目录下所有md文件
lapply(list.files(pattern = "\\.md$", full.names = TRUE), process_md)

运行这个脚本后，你的代码块就会被正确包裹成MATLAB代码块，编译时自然会有语法高亮。

关于你提到的knitr配置 #

你说的knitr::opts_chunk$set(code=MATLAB)其实不对，knitr的opts_chunk是用来配置R代码块的参数，并没有code这个选项。而且你不需要运行代码，完全没必要用R代码块来包裹MATLAB代码，直接用标准Markdown代码块配合pandoc的设置是最简洁的方案。

最后补充一下：如果是PDF输出，确保你的LaTeX环境支持语法高亮（一般默认的pandoc模板用的listings包已经支持MATLAB高亮了），HTML输出的话更是完全不需要额外配置，pandoc会自动生成带高亮的代码块。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者fan