如何调整ggplot堆叠柱状图中WT与Mutant分组的显示顺序？

问题分析 #

你的代码中，name列（包含WT和Mutant）默认按字母顺序排序（Mutant在前、WT在后），导致绘图时分面/堆叠顺序不符合需求。要让WT组在前、Mutant组在后，只需将name转换为指定顺序的因子即可。

修改后的代码 #

library(tidyverse)

df <- read.table(text = "Name   WT  Mutant
'cellular process'  200 2
'Biological phase'  150 5
'cell process'  100 9", header = TRUE)

df %>%
  pivot_longer(-Name) %>%
  # 强制指定name的因子水平顺序，WT在前，Mutant在后
  mutate(name = factor(name, levels = c("WT", "Mutant"))) %>%
  ggplot(aes(x = Name, y = value, fill = name)) +
  geom_col(position = position_stack()) +
  coord_flip() +
  facet_wrap(~name)

说明 #

• 通过mutate(name = factor(name, levels = c("WT", "Mutant")))自定义因子水平顺序后，ggplot会严格按照该顺序排列分面、填充分组的显示顺序。
• 若后续去掉facet_wrap做纯堆叠柱状图，该方法同样能保证WT在堆叠层的上方（结合coord_flip()后对应左侧）、Mutant在下方（右侧）。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Venkata Narasimha Kadali