PyCharm配置最新cutadapt后，Windows CMD仍显示旧版本的技术问询

这大概率是环境路径优先级在搞鬼——CMD默认调用的是旧版本cutadapt的路径，而你通过python3 -m pip更新的是PyCharm项目专属环境里的版本，两者根本不是同一个环境，所以更新后CMD里还是老版本。

接下来分步骤排查和解决：

第一步：明确两个环境的位置 #

• 先找PyCharm项目环境的路径：
  打开PyCharm，进入你的项目，依次点File > Settings > Project: [你的项目名] > Python Interpreter，在已安装包列表里找到cutadapt，点击右侧的小箭头，就能看到它的安装路径，同时记下这个环境的python.exe所在路径（比如虚拟环境的话就是项目根目录\venv\Scripts\python.exe）。
• 再查CMD默认调用的路径：
  打开CMD，分别执行以下命令：

  where python
  where cutadapt
  

  这两个命令会列出系统里所有匹配的可执行文件路径，CMD默认会用列表最顶部的那个——不出意外的话，旧版本的cutadapt路径排在你PyCharm环境路径的前面。

第二步：针对性解决（按推荐优先级排序） #

方案1：临时调用PyCharm环境的cutadapt #

如果只是偶尔需要在CMD里用新版本，直接用PyCharm环境的Python来调用即可，比如：

C:\Users\你的用户名\PycharmProjects\你的项目名\venv\Scripts\python.exe -m cutadapt --version

把上面的路径换成你自己的PyCharm环境Python路径，就能直接调用最新版本了。

方案2：调整环境变量优先级（永久解决） #

让PyCharm项目环境的路径优先被系统找到：

1. 右键此电脑 > 属性 > 高级系统设置 > 环境变量
2. 在系统变量区域找到Path，点击「编辑」
3. 把PyCharm项目环境的Scripts路径（比如项目根目录\venv\Scripts）或者对应的Python安装路径，移到Path列表的最顶部
4. 点击所有弹窗的「确定」，然后关闭所有CMD窗口重新打开，再执行cutadapt --version，就能看到新版本了。

方案3：卸载旧版本cutadapt #

如果旧版本是安装在系统全局Python里，且你不需要保留它，可以直接卸载：
在CMD里执行旧版本对应的Python的卸载命令，比如：

python -m pip uninstall cutadapt

卸载完成后，CMD就会自动找到优先级更高的PyCharm环境里的新版本。

额外提醒 #

如果你用的是PyCharm的虚拟环境，记得在CMD里操作时先激活虚拟环境：进入虚拟环境的Scripts目录，执行activate命令，之后再用pip更新或调用cutadapt，所有操作都会作用在项目环境里，不会再和全局环境混淆。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者rainbow12