Ubuntu 18.04下R 3.5无法识别GDAL致rgdal安装失败求助

我之前也碰到过类似的GDAL版本冲突导致R包安装失败的情况，结合你的环境信息，咱们一步步来解决：

1. 先理清系统里的GDAL版本冲突 #

你的系统里同时存在GDAL 2.2和2.4的组件（gdal-data是2.4，其他核心组件是2.2），这种版本不一致很容易导致依赖混乱，首先要把所有GDAL组件统一到同一个版本：

如果你想保留GDAL 2.2（和QGIS内置的版本匹配），执行以下命令重新安装所有组件：

sudo apt-get install --reinstall gdal-bin=2.2.3+dfsg-2 gdal-data=2.2.3+dfsg-2 libgdal20=2.2.3+dfsg-2 python-gdal=2.2.3+dfsg-2 python3-gdal=2.2.3+dfsg-2

2. 确保libgdal-dev正确安装（关键！） #

gdal-config是由libgdal-dev包提供的，之前的安装可能因为版本冲突没装到位，彻底重装这个包：

sudo apt-get remove --purge libgdal-dev
sudo apt-get install libgdal-dev libproj-dev

执行完后验证：

• 输入which gdal-config，应该输出/usr/bin/gdal-config
• 输入gdal-config --version，应该返回2.2.3

3. 让R正确识别gdal-config #

如果上面步骤做完后，R还是找不到gdal-config，可能是R的环境变量PATH里没包含它的路径。在R控制台里手动设置后再安装：

# 把gdal-config所在的路径加入R的PATH
Sys.setenv(PATH = paste("/usr/bin", Sys.getenv("PATH"), sep = ":"))
# 从源码安装rgdal
install.packages("rgdal", type = "source")

4. 备选方案：直接安装系统预编译的R包 #

如果源码编译还是有问题，可以试试Ubuntu官方源里的预编译rgdal包，这样能跳过编译过程：

sudo apt-get install r-cran-rgdal

为什么会出现这个问题？ #

核心原因是系统中GDAL组件版本不统一，导致libgdal-dev安装后gdal-config无法正常被R识别；另外QGIS内置的GDAL是独立运行的，不会影响系统层面的GDAL，但系统本身的版本冲突才是问题根源。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Sergio Bolívar