如何用awk为文件中>开头的序列行添加对应seqnum前缀？

直接用以下awk命令即可实现需求：

awk '/^# Sequence Data:/ {
    match($0, /seqnum=([0-9]+)/, arr)
    seqnum = arr[1]
}
/^>/ {
    print substr($0, 1, 1) seqnum "-" substr($0, 2)
}
!/^#|^>/ { print }' input.txt > output.txt

命令说明 #

1. 捕获seqnum值：当遇到以# Sequence Data:开头的行时，通过正则匹配提取seqnum=后的数字，存入变量seqnum中，后续的>行都会使用这个值作为前缀。
2. 处理目标行：对以>开头的行，将其拆分为>符号和后续内容两部分，在中间插入seqnum-后重新拼接输出。
3. 保留其他行：非注释、非目标行的内容直接原样输出，确保文件其他结构不受影响。

将上述命令中的input.txt替换为你的实际文件名，运行后处理结果会保存到output.txt中，完全符合你需要的格式。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者plnnvkv