点云编码遇GLIBCXX_3.4.29缺失报错，更新环境后仍未解决求助

问题场景 #

我在开展点云编解码器相关工作，执行以下编码命令时：

$ python vmuc.py compress /home2/kubra/JPEG/Stanford_Area_2.ply ../models/Geometry-only/Codec/0.00025/checkpoint_best_loss.pth.tar ../results/G0.00025

反复出现报错，核心错误信息为：

ImportError: /lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.29' not found (required by /home/kubra/anaconda3/envs/myenv/lib/python3.9/site-packages/scipy/spatial/_ckdtree.cpython-39-x86_64-linux-gnu.so)

已尝试更新libstdc++、创建新Python环境并更新依赖包，但问题仍未解决。

可行解决办法 #

• 优先调用conda环境内的libstdc++
  你的scipy是conda环境中安装的，系统libstdc++版本不足，可通过环境变量让程序优先加载conda环境内的库：

  1. 找到conda环境下的libstdc++.so.6路径，示例路径为/home/kubra/anaconda3/envs/myenv/lib/libstdc++.so.6
  2. 执行命令前设置环境变量：

  export LD_PRELOAD=/home/kubra/anaconda3/envs/myenv/lib/libstdc++.so.6
  python vmuc.py compress /home2/kubra/JPEG/Stanford_Area_2.ply ../models/Geometry-only/Codec/0.00025/checkpoint_best_loss.pth.tar ../results/G0.00025
  

  也可将该环境变量添加到conda环境的激活脚本中，实现自动生效。

• 降级scipy到适配版本
  高版本scipy对libstdc++要求较高，可安装低版本scipy（如1.7.x系列，对GLIBCXX要求低于3.4.29）：

  conda activate myenv
  pip uninstall scipy -y
  pip install scipy==1.7.3
  

  安装完成后重新运行原命令测试。

• 手动更新系统libstdc++（需root权限）
  若拥有服务器root权限，可手动替换系统的libstdc++文件：

  1. 先备份原文件：

  sudo cp /lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6 /lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6.bak
  

  2. 复制conda环境中的库到系统目录：

  sudo cp /home/kubra/anaconda3/envs/myenv/lib/libstdc++.so.6 /lib/x86_64-linux-gnu/
  

  注意：此操作可能影响系统其他程序，务必先备份。

• 从源码编译scipy
  若上述方法无效，可在当前conda环境中从源码编译scipy，适配系统libstdc++版本：

  conda activate myenv
  pip uninstall scipy -y
  # 安装编译依赖
  conda install gcc_linux-64 gxx_linux-64
  # 源码安装scipy
  pip install scipy --no-binary :all:
  

内容的提问来源于stack exchange，提问作者obby