Ubuntu上RStudio Server中DBI包重复安装无法卸载的问题

问题背景 #

在Ubuntu 20.04.4 LTS的RStudio Server（版本2022.07.1+554 "Spotted Wakerobin"）中，DBI包同时存在于.libpaths()[1]和.libpaths()[3]两个库路径下，执行remove.packages("DBI",lib = .libPaths()[3])无法卸载后者的旧版本，重启R、重复操作均无效。

解决步骤 #

1. 获取目标库的绝对路径
   在RStudio控制台执行：

   cat(.libPaths()[3])
   

   复制输出的绝对路径（例如/usr/lib/R/site-library）。

2. 手动删除目标路径下的DBI包
   退出RStudio Server，在Ubuntu终端执行以下命令（替换<目标绝对路径>为第一步获取的路径）：

   sudo rm -rf <目标绝对路径>/DBI
   

   系统级库路径通常需要sudo权限才能删除文件，这是remove.packages()命令失效的常见原因。

3. 验证删除结果
   重新打开RStudio Server，执行以下命令确认卸载：

   find.package("DBI", lib.loc = .libPaths()[3])
   

   若返回Error in find.package...则说明该路径下的DBI已被删除，同时刷新RStudio包窗口再次确认。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Lazarus Thurston