如何在R Markdown博士论文的子文档间添加可点击跳转链接？

你之前的链接指向了原始Rmd文件，所以无法在生成的PDF内跳转。下面提供两种适配你当前环境的解决方案：

方法一：纯R Markdown + LaTeX锚点 #

1. 给目标标题添加锚点：在需要跳转的子文档（比如child1.Rmd）的标题后加上{#自定义ID}，示例：

# Child document 1 {#header1}

2. 在跳转文档中引用锚点：在child2.Rmd里用Markdown链接格式指向该锚点，示例：

This is my second child document. Here I want a link to [Child document 1](#header1).

或者用更稳妥的LaTeX语法：

This is my second child document. Here I want a link to \ref{header1}.

编译主文档后，PDF内的链接会直接跳转到child1.Rmd中对应标题的位置。

方法二：用bookdown（更适合博士论文长文档） #

bookdown专门针对长文档的交叉引用优化，步骤如下：

1. 安装bookdown：

install.packages("bookdown")

2. 修改主文档输出格式：

---
output: 
  bookdown::pdf_book:
        latex_engine: pdflatex
---
```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = F)

\newpage

3. **子文档设置标签**：在`child1.Rmd`的标题处添加bookdown风格标签：
```markdown
# Child document 1 {#chap:child1}

4. 引用跳转：在child2.Rmd中使用以下任意一种方式：

• Markdown链接：

This is my second child document. Here I want a link to [Child document 1](#chap:child1).

• 自动带章节号的交叉引用：

This is my second child document. Here I want a link to Chapter \@ref(chap:child1).

这种方式不仅支持跳转，还能自动同步章节编号，更符合学术论文的格式规范。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Rheum_Glutinosa