如何解决R Markdown中加载R文件时的矩阵转换连接错误？

核心原因 #

报错本质是R无法定位到你指定的data/a_a.csv和data/b_b.csv文件，大概率是路径错误、文件缺失或者工作目录不匹配导致的。

具体排查&解决步骤 #

• 核对文件存在性
  确认项目文件夹下确实有data子文件夹，且里面存在a_a.csv和b_b.csv两个文件。注意R在Linux/macOS系统里区分文件名大小写，别把A_A.csv写成a_a.csv。

• 检查当前工作目录
  在R Markdown中运行以下代码查看当前工作目录：

  getwd()
  

  这个目录应该是包含data文件夹的项目根目录。如果不对，用代码手动设置：

  setwd("你的项目根目录绝对路径")
  

  更稳妥的方式是用RStudio打开项目的.Rproj文件，工作目录会自动匹配项目根目录。

• 用绝对路径测试
  先把CSV文件的绝对路径写进代码（比如Windows路径"C:/Users/xxx/MyProject/data/a_a.csv"，macOS/Linux路径"/Users/xxx/MyProject/data/a_a.csv"），测试能否正常读取。如果可以，说明相对路径的问题，回到前面调整工作目录即可。

• 排查文件权限问题
  极少数情况是文件被其他软件锁定（比如Excel打开着CSV文件），或者Linux/macOS下没有读取权限。关闭占用文件的软件，Linux/macOS用户可以用以下命令给文件加读权限：

  chmod +r data/*.csv
  

额外建议 #

写R Markdown时尽量用项目工作流：创建.Rproj项目文件，所有资源都放在项目目录下，用相对路径引用文件，这样换设备或分享项目时不会再出路径问题。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Drake