在EKS（Kubernetes v1.15）中使用EBS卷部署MySQL失败求助

从你提供的kubectl logs输出可以明确看出问题根源：

2020-04-09T11:23:26.920523Z 0 [ERROR] --initialize specified but the data directory has files in it. Aborting.

官方MySQL镜像的启动脚本会在首次启动时初始化数据库文件，但如果挂载的数据目录中已经存在文件（哪怕是之前残留的日志、临时文件或未清理的数据库文件），就会触发这个错误。而你之前用本地卷能正常运行，大概率是因为本地卷的/data/mysql目录是全新的空目录，没有残留内容。

下面是针对不同场景的解决方案：

方案1：清理现有EBS卷的内容 #

如果你是直接通过awsElasticBlockStore挂载已有EBS卷（比如你示例中的vol-09df5a8d4c0f2da62），可以临时启动一个清理Pod来删除卷内所有文件：

apiVersion: v1
kind: Pod
metadata:
  name: ebs-cleanup
spec:
  containers:
  - name: busybox
    image: busybox:latest
    command: ["sh", "-c", "rm -rf /data/* && rm -rf /data/.* 2>/dev/null && exit"]
    volumeMounts:
    - name: mysql-data
      mountPath: /data
  volumes:
  - name: mysql-data
    awsElasticBlockStore:
      volumeID: "vol-09df5a8d4c0f2da62"
      fsType: ext4
  restartPolicy: Never

执行以下命令运行清理Pod：

kubectl apply -f ebs-cleanup.yaml

等待Pod运行完成（可以用kubectl get pods查看状态为Completed），然后删除这个清理Pod：

kubectl delete pod ebs-cleanup

之后再重新启动你的MySQL Pod，应该就能正常初始化了。

方案2：重新创建PVC获取全新EBS卷 #

如果你是通过PVC绑定StorageClass的方式使用EBS卷：

• 首先删除现有的PVC和对应的PV（如果PV是手动创建的）：

  kubectl delete pvc mysql
  # 如果是手动创建的PV，也一并删除
  kubectl delete pv mysql
  

• 然后重新创建PVC：
  因为默认的EBS StorageClass（或者你自定义的manual类）的reclaimPolicy默认是Delete，删除PVC后对应的EBS卷会被自动销毁，重新创建PVC会分配一个全新的空卷，这样MySQL初始化时就不会遇到已有文件的问题了。

额外注意事项 #

• 如果你需要保留EBS卷中的数据，那说明你之前已经在这个卷上运行过MySQL，此时不应该让镜像执行初始化流程。可以在MySQL的Deployment或Pod配置中添加环境变量MYSQL_ALLOW_EMPTY_PASSWORD（或者指定MYSQL_ROOT_PASSWORD），镜像会自动检测数据目录是否有内容，有数据时直接启动服务而非执行初始化。
• 对于EKS 1.15版本，额外检查EBS卷的挂载权限是否符合MySQL用户（mysql用户，UID通常是999）的需求，避免后续出现权限不足的问题。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Iduoad