在二项式GLM模型中使用对照位点比例作为偏移项的数据分析问询
统计模型构建疑问:处理措施对迁徙鸟类幼鸟比例的影响分析
- 研究目的:验证处理措施对迁徙鸟类种群中幼鸟比例的影响
- 实验设计:
- 实验位点:每日统计并区分幼鸟/成鸟,每隔一天实施处理,无处理日期作为内部对照
- 对照位点:在邻近未受处理的位点每日监测幼鸟比例,用于控制迁徙物候对幼鸟比例的干扰
- 分析计划:打算用二项式GLMM做分析,以幼鸟比例为因变量,处理为分类解释变量,日期设为随机截距因子,用每日鸟类总数作为权重消除样本量差异,但不清楚如何合理纳入对照位点的数据。查资料得知可将对照数据用作偏移项,但具体操作存疑,有两个核心问题:
- 对照位点的幼鸟比例是比例形式,会不会对模型的链接函数产生影响?
- 把处理和对照位点幼鸟比例做交互项(模型公式:
~ Treatment*Juv.prop.cntrl.site),是不是比用作偏移项的效果更好?
目前我构建的模型代码如下,不确定是否合理,尤其是偏移项的设置是否正确:
glm(Juv.prop.exp.site ~ Treatment + Day, offset = Juv.prop.cntrl.site, weights = Tot.birds.exp.site, data = df, family = Binomial)
注:Juv.prop.exp.site是实验位点幼鸟数与总鸟数(幼鸟+成鸟)的比值;数据从第11天开始记录,前10天未观测到目标物种。
内容的提问来源于stack exchange,提问作者Yael Lehnardt
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