将字符串列表读取到pandas DataFrame时出现EmptyDataError错误

问题原因 #

使用split('\n\n')分割文本时，会生成包含空字符串的块——比如文件开头/结尾的空行、连续多个空行，都会被分割成空块。当pd.read_csv处理空字符串时，因没有可解析的列，就会触发EmptyDataError。

解决方案 #

在处理每个块之前，先过滤掉空的或仅含空白字符的块，有两种实现方式：

方式1：分割时直接过滤

with open(txt_full_paths[0], 'r') as file: 
    # 分割后过滤掉空块（含仅空白字符的块）
    chunks = [chunk for chunk in file.read().split('\n\n') if chunk.strip()]

方式2：循环内判断处理

dfs = []
for chunk in chunks:
    cleaned_chunk = chunk.strip()
    # 仅处理非空的有效块
    if cleaned_chunk:
        df = pd.read_csv(StringIO(cleaned_chunk), sep='\t').transpose()
        dfs.append(df)

验证方法 #

如果想确认问题根源，可以打印所有块的内容，查看是否存在空块：

print([repr(chunk) for chunk in chunks])

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Jonathan Lefebre