如何在MicroManager的BeanScript中为ImageJ结果记录时间戳？

我完全不懂编程，现在要记录受规律刺激的心肌细胞中Fluo-4荧光染料随时间变化的强度并生成yz图，用的是基于ImageJ的MicroManager工具，用类似Java的BeanScript写了脚本，多次尝试后得到如下代码：

import ij.*;

numberOfImages = 25;

//the image window must be already open in the GUI (press "Snap Image" at least once) before running this script

IJ.run("Set Measurements...", "integrated redirect=None decimal=3");

for (int i=0; i < numberOfImages; i++)
{
images = mm.live().snap(true);
img = images.get(0);
IJ.run("Measure");
IJ.timeStamp = getTime();  
IJ.setResult("Time", i, timeStamp);
Thread.sleep(10);
}

问题是这两行记录时间的代码在ImageJ里去掉前缀“IJ.”能正常运行，但在MicroManager的BeanScript里不行，去掉这两行脚本能跑，但每次循环时长有毫秒级波动，必须记录实际时间才行。脚本管理器报错如下：

Line 14: evaluation error : Sourced file: inline evaluation of: ``import ij.*; numberOfImages = 25; //the image window must be already open in t . . . '' : Field access: bsh.ReflectError: No such field: timeStamp

解决方法 #

问题核心是MicroManager的BeanScript环境中，IJ类并没有timeStamp这个字段，而且getTime()也不是该环境下的可用函数。直接用Java标准的时间获取方法即可解决：

1. 若需要从1970年开始的绝对毫秒时间戳，把原脚本中那两行时间记录代码替换为：

long currentTime = System.currentTimeMillis();
IJ.setResult("Time", i, currentTime);

2. 更适合实验场景的是记录相对开始时间的毫秒数，数据更直观，修改方式如下：
   • 在循环前先记录初始时间
   • 循环内计算已流逝的时间

修改后的完整脚本：

import ij.*;

numberOfImages = 25;
long startTime = System.currentTimeMillis(); // 记录实验开始时间

//the image window must be already open in the GUI (press "Snap Image" at least once) before running this script

IJ.run("Set Measurements...", "integrated redirect=None decimal=3");

for (int i=0; i < numberOfImages; i++)
{
images = mm.live().snap(true);
img = images.get(0);
IJ.run("Measure");
long elapsedTime = System.currentTimeMillis() - startTime; // 计算从开始到当前的毫秒数
IJ.setResult("Time", i, elapsedTime);
Thread.sleep(10);
}

这样就能准确记录每次拍照的实际时间，消除循环波动带来的误差。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者goose7