CMake指定gcc-8编译AmberTools仍默认用gcc-5报错求助

问题背景 #

在Ubuntu 16.04.7 LTS上编译AmberTools 22，系统默认gcc/g版本为5.4.0，但AmberTools要求最低gcc-6。已安装gcc-8和g-8，通过CMAKE_C_COMPILER和CMAKE_CXX_COMPILER指定路径执行CMake命令：

cmake $AMBER_PREFIX/amber22_src \
-DCMAKE_INSTALL_PREFIX=$AMBER_PREFIX/amber22 \
-DCOMPILER=GNU \
-DMPI=FALSE -DCUDA=TRUE -DINSTALL_TESTS=TRUE \
-DDOWNLOAD_MINICONDA=TRUE \
-DCMAKE_C_COMPILER=/usr/bin/gcc-8 -DCMAKE_CXX_COMPILER=/usr/bin/g++-8 \

但CMake仍识别到C/C++/Fortran编译器为GNU 5.4.0，并抛出错误：

Error: Amber requires at least g++-6.0

从错误日志可见，CMake实际调用的是系统默认的/usr/bin/gcc、/usr/bin/g++和/usr/bin/gfortran，而非指定的gcc-8版本。

问题根源 #

1. CMake缓存残留：之前执行过的CMake配置会在build目录生成缓存文件，保存了默认编译器路径，导致新指定的参数未生效，日志中也明确提示"You have changed variables that require your cache to be deleted"。
2. Fortran编译器未指定：仅指定了C/C编译器，但AmberTools依赖Fortran编译，系统默认gfortran仍为5.4.0，CMake会自动关联使用同版本的C/C编译器。
3. COMPILER=GNU参数冲突：该参数会强制CMake调用系统默认的GNU编译器套件，覆盖手动指定的编译器路径。

解决方案 #

1. 清理CMake缓存 #

彻底删除原build目录，重建干净的编译环境：

rm -rf /media/gpu-1/GPU_1_2TB/Ambertools22/amber22_src/build
mkdir -p /media/gpu-1/GPU_1_2TB/Ambertools22/amber22_src/build
cd /media/gpu-1/GPU_1_2TB/Ambertools22/amber22_src/build

2. 安装对应版本的Fortran编译器 #

AmberTools依赖Fortran，需安装与gcc-8配套的gfortran-8：

sudo apt update && sudo apt install gfortran-8

3. 重新执行CMake配置 #

移除COMPILER=GNU参数，同时完整指定C、C++、Fortran三个编译器的路径：

cmake $AMBER_PREFIX/amber22_src \
-DCMAKE_INSTALL_PREFIX=$AMBER_PREFIX/amber22 \
-DMPI=FALSE -DCUDA=TRUE -DINSTALL_TESTS=TRUE \
-DCMAKE_C_COMPILER=/usr/bin/gcc-8 \
-DCMAKE_CXX_COMPILER=/usr/bin/g++-8 \
-DCMAKE_Fortran_COMPILER=/usr/bin/gfortran-8

4. 验证与编译 #

配置成功后，CMake日志应显示编译器版本为8.x系列：

The C compiler identification is GNU 8.x.x
The CXX compiler identification is GNU 8.x.x
The Fortran compiler identification is GNU 8.x.x

之后执行编译安装：

make install
source $AMBER_PREFIX/amber22/amber.sh

内容的提问来源于stack exchange，提问作者AKA