Bash脚本Globbing文件名后生成.gz文件时通配符失效问题求助

问题背景 #

目录中有一批格式规范的文件（如1.SNV.111-T.vcf），需要借助包含文件名片段（如111-T）的文本文件，通过通配符匹配完整文件名，最终用bgzip生成带.gz后缀的压缩文件。

原编写的Bash脚本如下：

#!/bin/bash
while getopts f: flag
do
        case "${flag}" in
                f) file=${OPTARG};;
esac
done

while IFS="" read -r p || [ -n "$p" ]
do
        vcf="*${p}.vcf"

        bgzip -c ${vcf} > ${vcf}.gz

done < $file

脚本能成功执行bgzip，但输出文件名会变成*111-T.vcf.gz——因为输出路径中的通配符不会自动展开（目标文件不存在时，Shell不会解析通配符），导致带*的字符串被直接作为文件名。

修正后的脚本 #

#!/bin/bash
while getopts f: flag
do
    case "${flag}" in
        f) file="${OPTARG}";;
    esac
done

while IFS="" read -r p || [ -n "$p" ]
do
    # 遍历所有匹配通配符的文件，让Shell自动展开通配符
    for vcf in *"${p}".vcf; do
        # 确认当前路径是真实文件，避免无匹配时处理通配符字符串本身
        if [ -f "$vcf" ]; then
            bgzip -c "$vcf" > "${vcf}.gz"
        fi
    done
done < "$file"

关键说明 #

• 用for循环遍历通配符表达式*"${p}".vcf，Shell会自动将其展开为所有匹配的实际文件名
• 添加[ -f "$vcf" ]判断，防止当没有任何文件匹配时，误将*${p}.vcf这个字符串当作文件名处理
• 所有变量用双引号包裹，避免文件名包含空格、特殊字符时出现解析错误

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Liam