Ubuntu 22.04 Docker中install.packages安装R包提示对象未找到

错误原因 #

报错提示object 'readxl' not found，核心问题是Docker RUN命令的引号解析错误：

• 原命令外层用双引号包裹R代码，内层包名也使用双引号但未做转义处理。
• Shell解析命令时会去掉内层未转义的双引号，导致R收到的代码里包名没有引号，被当作变量而非字符串处理，自然找不到对应的对象。

解决方法 #

两种修正方式任选其一即可：

方式1：内层改用单引号 #

将包名的双引号替换为单引号，避免和外层双引号冲突：

RUN R -e "install.packages(c('readxl','zoo','plotly','RcppRoll','shiny','tidyverse','shinyWidgets','shinythemes','metR','writexl','shinydashboard','lubridate','sjmisc','DBI','dplyr','dbplyr','odbc'), repos='https://cloud.r-project.org/')"

方式2：转义内层双引号 #

对内层双引号添加转义符\，确保Shell解析时保留引号：

RUN R -e "install.packages(c(\"readxl\",\"zoo\",\"plotly\",\"RcppRoll\",\"shiny\",\"tidyverse\",\"shinyWidgets\",\"shinythemes\",\"metR\",\"writexl\",\"shinydashboard\",\"lubridate\",\"sjmisc\",\"DBI\",\"dplyr\",\"dbplyr\",\"odbc\"), repos='https://cloud.r-project.org/')"

非Docker环境正常的原因 #

非Docker环境下直接在R控制台运行时，代码无需经过Shell的引号解析步骤，你传入的是带正确引号的内容，R能直接识别包名为字符串，因此运行正常。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Friedbert