如何在R中遍历多子目录读取指定的cats.csv文件

第一步：修正文件路径获取逻辑 #

你可以跳过先遍历子文件夹的步骤，直接递归查找所有cats.csv文件，这样更简洁且不易出错：

parent_folder <- "你的父文件夹路径"
# 精确匹配文件名，避免误抓类似cats1.csv的文件
cat_files <- list.files(path = parent_folder, pattern = "^cats\\.csv$", full.names = TRUE, recursive = TRUE)

第二步：读取所有CSV文件 #

基础包实现（无需额外安装包）

# 读取所有文件，得到数据框列表
all_cats <- lapply(cat_files, function(path) {
  # 可选：指定编码避免乱码，根据实际情况调整
  read.csv(path, encoding = "UTF-8")
})

# 若需要合并成单个大数据框
all_cats_combined <- do.call(rbind, all_cats)

tidyverse工具链实现（更简洁的合并）

library(purrr)
library(dplyr)

# 读取并直接合并为单个数据框
all_cats_combined <- map_dfr(cat_files, ~read.csv(.x, encoding = "UTF-8"))

原代码可能失败的原因排查 #

1. 路径问题：dir(sub_folders, ...)传入多路径时，可能混入空值（部分子文件夹无cats.csv），可先过滤：

   cat_files <- cat_files[cat_files != ""]
   

2. 编码问题：CSV文件编码与R默认编码不匹配，需在read.csv中指定encoding参数。
3. 文件匹配问题：原pattern = "cats"会匹配所有含cats的文件名，建议用精确匹配^cats\\.csv$。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者xoxo