安装R包iClusterPlus时遇Fortran 90编译器不支持错误求助

• 先激活你的conda环境，在终端里运行命令确认gfortran的安装路径：

  which gfortran
  

  记下输出的路径，比如/home/user/miniconda3/envs/r_env/bin/gfortran

• 打开R会话，设置环境变量让R识别conda里的编译器：

  Sys.setenv(FC = "/你的/gfortran/路径")
  Sys.setenv(CC = "/你的/gcc/路径")
  

  （gcc路径可以用which gcc获取，通常和gfortran在同一目录）

• 重新执行安装命令：

  BiocManager::install("iClusterPlus")
  

备选方案：手动指定编译器安装源码包 #

如果上面的方法没生效，试试手动下载源码包安装：

1. 从Bioconductor官网下载iClusterPlus的源码tar.gz包
2. 在R中运行：

   install.packages("/本地/路径/iClusterPlus_xxx.tar.gz", repos = NULL, type = "source", configure.args = "--with-fortran=/你的/gfortran/路径")
   

注意事项 #

• 必须在激活conda环境的状态下启动R，否则R找不到conda安装的编译器
• 验证gfortran版本：终端运行gfortran --version，确保版本≥4.8（这是支持Fortran 90的最低要求）

内容的提问来源于stack exchange，提问作者melolilili