Ubuntu AWS EC2实例安装shinymanager报错及库路径调整求助

一、修复libsodium系统依赖缺失问题 #

shinymanager依赖系统级的libsodium开发库，先通过apt安装对应依赖：

sudo apt update && sudo apt install -y libsodium-dev

完成后重新安装shinymanager：

install.packages("shinymanager", dependencies = TRUE)

二、调整R包安装路径到/usr/local/lib/R/site-library #

方法1：安装时直接指定路径 #

执行安装命令时通过lib参数明确目标路径：

install.packages("shinymanager", lib = "/usr/local/lib/R/site-library", dependencies = TRUE)

批量安装其他包时，同样可以添加该参数统一指定路径。

方法2：全局配置默认库路径 #

修改R的全局配置文件，让sudo R安装的包默认写入site-library：

1. 打开R的系统配置文件：

sudo nano /etc/R/Renviron.site

2. 添加以下配置内容：

R_LIBS_USER="/usr/local/lib/R/site-library"
R_LIBS_SITE="/usr/local/lib/R/site-library"

3. 保存退出后，重启R会话，后续安装的包会自动使用该路径。

方法3：临时调整当前R会话的库路径 #

在R中执行命令查看当前库路径：

.libPaths()

若需要临时将目标路径设为优先位置，运行：

.libPaths(c("/usr/local/lib/R/site-library", .libPaths()))

后续在该会话中安装的包会默认放到指定路径。

验证配置结果 #

安装完成后，在R中执行以下命令确认shinymanager的安装路径：

find.package("shinymanager")

返回/usr/local/lib/R/site-library/shinymanager则表示配置成功。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Eizy