Linux下筛选含.spring无.fastq.gz文件的目录及相关查询

一、获取仅含.spring文件、不含.fastq.gz文件的目录下的.spring文件路径 #

你的原命令没有过滤掉那些本身包含.fastq.gz的目录，而是单纯排除了.fastq.gz文件，所以达不到预期效果。可以用shell循环结合条件判断实现需求：

for dir in $(find "$PWD" -name "*.spring" -printf '%h\n' | sort -u); do
    # 检查当前目录下是否存在.fastq.gz文件，无则输出该目录下的.spring文件
    if ! ls "$dir"/*.fastq.gz 1>/dev/null 2>&1; then
        find "$dir" -maxdepth 1 -name "*.spring"
    fi
done

命令说明： #

• find "$PWD" -name "*.spring" -printf '%h\n' | sort -u：找出所有包含.spring文件的目录，%h输出文件所在目录，sort -u去重避免重复处理同一目录
• ! ls "$dir"/*.fastq.gz 1>/dev/null 2>&1：通过ls检查目录下是否有.fastq.gz，重定向输出和错误到/dev/null避免冗余提示，!表示如果没有找到则执行后续命令
• find "$dir" -maxdepth 1 -name "*.spring"：只输出当前目录下的.spring文件，若需要递归查找子目录里的.spring，去掉-maxdepth 1即可

二、检查目录是否同时包含.fastq.gz和.spring文件 #

单个目录检查 #

直接用条件判断即可：

dir="/path/to/your/directory"
if ls "$dir"/*.spring 1>/dev/null 2>&1 && ls "$dir"/*.fastq.gz 1>/dev/null 2>&1; then
    echo "目录 $dir 同时包含两种文件"
else
    echo "目录 $dir 不同时包含两种文件"
fi

批量找出所有同时包含两种文件的目录 #

用find的-exec参数批量处理：

find "$PWD" -type d -exec sh -c 'ls "$0"/*.spring 1>/dev/null 2>&1 && ls "$0"/*.fastq.gz 1>/dev/null 2>&1' {} \; -print

命令说明： #

• -type d：只查找目录
• -exec sh -c '...' {} \;：对每个目录执行shell命令，检查是否同时存在两种文件
• -print：当条件满足时，输出该目录路径

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Adarsh