SSH连接外部服务器时找不到Guix安装的samtools等命令怎么办？

临时生效（当前终端会话） #

直接执行以下命令，将guix.profile的bin目录添加到系统环境变量PATH中：

export PATH=$HOME/guix.profile/bin:$PATH

执行完毕后，再尝试运行samtools --version，即可正常调用软件。

永久生效（所有新登录会话） #

如果希望每次SSH登录服务器都自动加载该路径，需将配置写入bash的初始化文件：

1. 打开用户目录下的.bashrc文件（若使用zsh则编辑.zshrc）：

nano ~/.bashrc

2. 在文件末尾添加一行：

export PATH=$HOME/guix.profile/bin:$PATH

3. 保存退出后，执行以下命令让配置立即生效：

source ~/.bashrc

问题原因说明 #

系统查找可执行命令时，只会遍历PATH环境变量中列出的目录。你通过Guix安装的软件存放在guix.profile/bin下，但该目录未被加入PATH，因此bash无法直接识别samtools这类命令名。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Michela Francesconi