如何在GNU Parallel中正确拼接字符串？文件名拼接异常排查

你的fastalist文件第一行末尾带有Windows风格的回车符（\r），当parallel输出{}.txt时，\r会让终端光标回到行首，随后输出的.txt会覆盖掉原字符串的前4个字符（1paz），最终显示为.txtA。第二行没有这个问题，说明它是Unix风格的换行（仅\n）。

提供三种可行方案：

• 转换文件换行格式：用dos2unix工具将文件转为Unix格式：

  dos2unix BuildFeatures/example/fastalist
  

  之后再执行你的原命令即可正常输出。

• 过滤回车符后再处理：在管道中加入tr -d '\r'去掉所有回车符：

  cat BuildFeatures/example/fastalist | tr -d '\r' | parallel -j 5 echo {}.txt
  

• 用parallel自带参数处理：使用--trim r参数自动去除行尾的回车符：

  parallel -j 5 -a BuildFeatures/example/fastalist --trim r echo {}.txt
  

  （这里直接用-a参数指定输入文件，比cat管道更简洁）

内容的提问来源于stack exchange，提问作者WuGuo