SLURM作业数组$SLURM_ARRAY_TASK_ID失效问题求助

你的问题根源在于SLURM指令的拼写错误和重复定义，导致作业数组未正确生效：

核心问题 #

1. SLURM指令拼写错误：脚本中所有#SBACTH都是错误写法，正确应为#SBATCH。SLURM只会识别以#SBATCH开头的指令，错误拼写的行被当作普通注释，导致--array参数完全未被加载，作业并非数组模式运行，因此$SLURM_ARRAY_TASK_ID变量为空。
2. 重复定义数组参数：即使拼写正确，脚本中先后定义了--array=1-2和--array=1，后者会覆盖前者，最终只会运行1个任务。

修正后的批处理脚本 #

#!/bin/bash 
#SBATCH --time=01:59:00
#SBATCH --array=1-2
#SBATCH --job-name=job_array
#SBATCH --output=log/job-%A-%a.out
#SBATCH --error=log/job-%A-%a.err

echo 'Running code'
echo "Starting task" $SLURM_ARRAY_TASK_ID
python -u parse_test.py --var $SLURM_ARRAY_TASK_ID
echo 'Code done.'

额外验证步骤 #

• 提交作业前确保log目录存在，执行mkdir -p log避免SLURM因无法创建目录而报错。
• 提交后用squeue -u $USER查看任务状态，应显示两个数组任务（后缀为_1和_2）。
• 确认Python的argparse代码正确接收参数，示例如下：

import argparse

parser = argparse.ArgumentParser()
parser.add_argument('--var', type=int, required=True)
args = parser.parse_args()
print(f"Received task ID: {args.var}")

修正后重新提交作业，即可生成两个对应任务ID的输出/错误文件，且$SLURM_ARRAY_TASK_ID能正常传递给Python脚本。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者asorlik