使用R语言绘制热图报错：'x'为列表但无'x'和'y'组件

错误原因 #

heatmap.2()函数本身会直接生成热图，它的返回值是一个包含行/列索引、树状结构等元信息的列表，不是可被plot()函数识别的绘图对象。你额外调用plot(Heatmapp)，相当于把这个列表传给plot()，而plot()需要带有x/y分量的输入，因此触发报错。

修正后的代码 #

直接移除多余的plot()调用，heatmap.2()执行时会自动完成绘图：

library(gplots)
Heatmap <- function(InputMatrix, OutputPlotName){
  # 调用heatmap.2生成热图，无需额外plot
  heatmap.2(InputMatrix)
}

调用示例 #

Heatmap(InputMatrix=as.matrix(mtcars), OutputPlotName="heatmap")

补充：保存热图 #

如果需要将热图保存为文件，可以在heatmap.2()前后添加图形设备控制代码：

library(gplots)
Heatmap <- function(InputMatrix, OutputPlotName){
  # 打开png设备，设置输出路径和尺寸
  png(paste0(OutputPlotName, ".png"), width=800, height=600)
  heatmap.2(InputMatrix)
  # 关闭设备，完成保存
  dev.off()
}

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Colap