如何在macOS（含Apple Silicon）上从源码编译R？

一、解决你当前的M1 Mac编译错误 #

你已经安装了GNU Fortran但configure仍提示找不到，核心原因是ARM架构下Fortran的默认路径没被configure自动识别，手动指定路径即可：

1. 先确认GNU Fortran的安装路径：

   which gfortran
   

   用Homebrew安装的话，M1/M2 Mac的路径通常是/opt/homebrew/bin/gfortran，Intel Mac则是/usr/local/bin/gfortran。

2. 重新执行configure并指定Fortran编译器路径：

   ./configure FC=/opt/homebrew/bin/gfortran
   

   如果仍有问题，可补充指定Fortran 77编译器和优化参数：

   ./configure FC=/opt/homebrew/bin/gfortran F77=/opt/homebrew/bin/gfortran FFLAGS="-O2"
   

另外，务必确认Xcode命令行工具已正确安装并配置：

# 未安装的话执行这个
xcode-select --install
# 检查安装路径是否正确
xcode-select -p

正常返回应为/Applications/Xcode.app/Contents/Developer。

二、macOS 11+编译R的通用步骤（Intel/ARM通用） #

1. 安装必备依赖 #

• Xcode及命令行工具：提供C/C++编译器，是编译R的基础。
• GNU Fortran：R的部分核心模块依赖Fortran，必须安装。
• 可选依赖库：提升R的功能支持，比如网络、图像处理，用Homebrew一键安装：

  brew install curl libpng jpeg libtiff openmpi
  

2. 获取R源码 #

• 稳定版：从CRAN下载对应版本，比如：

  curl -LO https://cran.r-project.org/src/base/R-4/R-4.3.3.tar.gz
  

• 每日快照：你使用的补丁版源码：

  curl -LO https://stat.ethz.ch/R/daily/R-patched.tar.gz
  

3. 解压并进入源码目录 #

tar -xvf R-patched.tar.gz && cd R-patched

4. 配置编译选项 #

可指定安装路径（比如--prefix=/usr/local/R-patched），方便后续管理；也可根据需求添加功能开关（比如--enable-R-shlib编译动态库）。

5. 编译并安装 #

用多线程加速编译（-j后接CPU核心数，sysctl -n hw.ncpu自动获取核心数）：

make -j$(sysctl -n hw.ncpu)
sudo make install

三、Intel与ARM（Apple Silicon）Mac的编译差异 #

1. 依赖路径差异 #

• Intel Mac：Homebrew安装的工具/库默认在/usr/local/bin和/usr/local/opt
• ARM Mac：Homebrew安装的工具/库默认在/opt/homebrew/bin和/opt/homebrew/opt，所以configure时必须手动指定这些路径（比如前面的Fortran路径）

2. 架构识别与编译选项 #

• ARM Mac：configure会自动识别arm64架构，无需额外添加--enable-macos-arm64；如果需要交叉编译x86_64版本，可添加--host=x86_64-apple-darwin20（Big Sur对应darwin20）。
• Intel Mac：默认识别x86_64架构，兼容性更成熟，几乎无需额外架构相关配置。

3. 性能与兼容性 #

• ARM Mac：编译后的R会针对M1/M2的ARM架构优化，运行效率更高；但部分老旧R包可能暂不支持arm64，不过编译R本身无问题。
• Intel Mac：编译流程更稳定，遇到的兼容性问题更少，适合依赖较多老旧包的场景。

四、其他问题排查 #

• 如果configure提示缺少某类依赖（比如libcurl），可手动指定依赖路径：

  # ARM Mac
  ./configure --with-libcurl=/opt/homebrew/opt/curl
  # Intel Mac
  ./configure --with-libcurl=/usr/local/opt/curl
  

• 编译时出现链接错误，检查环境变量PATH是否包含Homebrew的bin路径，确保依赖库能被找到。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Mikael Jagan