MXLinux系统下R语言安装及启动失败问题求助

问题背景 #

我在MXLinux 5.16.0-5mx-amd64系统中按以下步骤安装R语言：

1. 添加GPG密钥：

   sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-key '95C0FAF38DB3CCAD0C080A7BDC78B2DDEABC47B7'
   

2. 添加仓库：

   sudo add-apt-repository 'deb http://cloud.r-project.org/bin/linux/debian bullseye-cran40/'
   

3. 更新升级系统：

   sudo apt update && sudo apt upgrade -y
   

4. 安装r-base：

   sudo apt install r-base -y
   

安装时出现rstudio missing or not found警告，但安装仍完成。启动R（执行R命令）时出现错误：

/usr/lib/R/bin/exec/R: symbol lookup error: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libblas.so.3: undefined symbol: sgemv_thread_n

已尝试的解决步骤 #

• 安装libopenblas-dev，确认已是最新版本
• 执行sudo update-alternatives --config libblas.so，报错：update-alternatives: error: no alternatives for libblas.so
• 执行sudo apt purge rstudio消除安装警告
• 执行sudo apt autoremove清理冗余文件
• 执行sudo apt-get install r-base-dev r-base r-base-core，提示包已是最新版本（4.2.2-1~bullseyecran.0），且已参考CRAN官方Debian安装指南，内容与所用教程一致
• 执行locate libblas.so.3得到以下输出：

  /etc/alternatives/libblas.so.3-x86_64-linux-gnu
  /opt/libblas.so.3.9.0
  /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libblas.so.3
  /usr/lib/x86_64-linux-gnu/atlas/libblas.so.3
  /usr/lib/x86_64-linux-gnu/atlas/libblas.so.3.10.3
  /usr/lib/x86_64-linux-gnu/blas/libblas.so.3
  /usr/lib/x86_64-linux-gnu/blas/libblas.so.3.9.0
  /usr/lib/x86_64-linux-gnu/openblas-pthread/libblas.so.3
  /var/lib/dpkg/alternatives/libblas.so.3-x86_64-linux-gnu
  

解决方案 #

一、彻底清除所有R及相关残留 #

1. 卸载所有R相关包

   sudo apt purge --autoremove r-base r-base-core r-base-dev r-recommended r-cran-*
   

2. 删除CRAN仓库配置文件

   sudo rm /etc/apt/sources.list.d/*cran*.list
   

3. 删除R的系统级配置文件和用户目录

   sudo rm -rf /usr/lib/R /etc/R
   rm -rf ~/.R ~/.rstudio-desktop ~/.rstudio-server
   

4. 清理APT缓存并更新源列表

   sudo apt clean && sudo apt update
   

二、重新安装R语言（修复BLAS依赖问题） #

1. 重置BLAS库替代项（解决符号未定义错误）
   先安装官方BLAS和OpenBLAS，再配置系统默认BLAS库：

   sudo apt install libblas-dev libopenblas-dev
   sudo update-alternatives --config libblas.so.3-x86_64-linux-gnu
   

   在弹出的选项中，选择/usr/lib/x86_64-linux-gnu/openblas-pthread/libblas.so.3（对应OpenBLAS的选项）并确认。

2. 重新添加CRAN仓库和密钥

   sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-key '95C0FAF38DB3CCAD0C080A7BDC78B2DDEABC47B7'
   sudo add-apt-repository 'deb http://cloud.r-project.org/bin/linux/debian bullseye-cran40/'
   sudo apt update
   

3. 安装R基础包

   sudo apt install r-base r-base-dev r-recommended -y
   

4. 验证安装
   执行R命令，若能正常进入R交互环境则安装成功。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Ginko-Mitten