优化使用Typed Memory Views与BLAS的Cython数组运算速度
Cython 3.0 数组运算性能优化问题与解决方案
场景说明
我正尝试最大化Cython 3.0代码的运算速度,该代码需循环执行矩阵-向量乘法、向量-向量加法、标量-向量乘法等数组操作来更新数组。目前采用typed memory views传递数组,借助BLAS(scipy.linalg.cython_blas)完成运算,大尺寸数组场景下性能优于Numba实现,但小数组场景中因内存拷贝开销过大,速度不如Numba。
核心问题
- 如何减少Cython实现的拷贝开销,使其性能接近移除拷贝后的Cython版本?
- 有无其他无需重写为纯C/C++的方法,可显著提升Cython数组运算速度?
优化成果
后续通过原地操作优化代码,将拷贝次数从14次降至2次;再通过循环外预分配数组进一步优化,最终实现全尺寸数组场景下性能超越Numba。
内容的提问来源于stack exchange,提问作者Eric
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