Anaconda3 Prompt执行Python命令路径正确但运行程序路径错误求助

作为Python和计算机科学新手，我正卡在Anaconda3环境下程序找不到已安装模块的问题上，为此写了TestPy.py文件来排查：

import sys;
print(sys.path)

# When printing path in Anaconda Prompt:
# ''
# 'C:\\Users\\evana\\anaconda3\\envs\\bulk\\python39.zip'
# 'C:\\Users\\evana\\anaconda3\\envs\\bulk\\DLLs'
# 'C:\\Users\\evana\\anaconda3\\envs\\bulk\\lib'
# 'C:\\Users\\evana\\anaconda3\\envs\\bulk'
# 'C:\\Users\\evana\\anaconda3\\envs\\bulk\\lib\\site-packages'

# When printing path in Program:
# 'C:\\Users\\evana\\Documents\\MyPrograms\\Python' <- directory of TestPy.py
# 'C:\\Python311\\python311.zip'
# 'C:\\Python311\\Lib'
# 'C:\\Python311\\DLLs'
# 'C:\\Python311'
# 'C:\\Python311\\Lib\\site-packages'

我对比了Anaconda3 Python控制台和直接运行TestPy.py时的sys.path输出，明显路径指向不同——控制台用的是Anaconda的bulk虚拟环境路径，而程序用的是系统安装的Python3.11路径，这应该就是程序找不到Anaconda模块的原因。

我试过把bulk环境的路径按顺序添加到系统环境变量里，强制程序优先检查该环境的模块，而且添加时用的是单个反斜杠，但即使通过Anaconda Prompt运行程序，问题依然存在。

这个问题在Anaconda的base环境里也一样：运行程序时打印的路径还是指向系统Python3.11，但Anaconda Prompt里base环境的sys.path是这样的：

''
'C:\\Users\\evana\\anaconda3\\python39.zip'
'C:\\Users\\evana\\anaconda3\\DLLs'
'C:\\Users\\evana\\anaconda3\\lib'
'C:\\Users\\evana\\anaconda3'
'C:\\Users\\evana\\anaconda3\\lib\\site-packages'
'C:\\Users\\evana\\anaconda3\\lib\\site-packages\\win32'
'C:\\Users\\evana\\anaconda3\\lib\\site-packages\\win32\\lib'
'C:\\Users\\evana\\anaconda3\\lib\\site-packages\\Pythonwin'

Anaconda官网提到系统安装的Python可能会造成干扰，但我不敢删除已安装的Python3.11或者修改它的系统路径。另外我用MSYS2装了C++编译器，路径是C:\msys64\mingw64\bin，推测对应Python3.10，但程序打印的路径全是Python3.11的，所以应该不是MSYS2的问题。

可以提供更多必要信息，求解决办法！

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Evan Abbott