AWS Genomics Nextflow workshop异常:AWS Batch任务卡RUNNABLE状态
AWS Genomics Nextflow Workshop 执行问题
实验背景
我们基于AWS Genomics Nextflow workshop开展实验,使用以下两个CloudFormation模板:
- Cloud9环境模板
- Nextflow全资源模板
已完成的执行步骤
- 使用具备管理员权限的IAM用户或root用户登录AWS控制台
- 通过Nextflow全资源模板解决了“VpcStack模板不可用”的问题,成功创建两个模板对应的所有资源
- 完成workshop中Cloud9环境配置的相关操作,达到预期配置结果
- 验证workshop中AWS资源相关内容,确认所有资源已通过Nextflow全资源模板自动创建完成
- 执行workshop中的命令
nextflow run hello
遇到的问题
AWS Batch任务在控制台显示为“Runnable”状态,但一直卡在此状态(后台正在创建Auto Scaling Group和EC2实例),无法完成预期的.fastq文件处理及结果输出
内容的提问来源于stack exchange,提问作者Rajkumar Duraisamy
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