R语言corrplot绘制相关图：如何忽略对角线NA消除问号？

我在R语言中完成相关性分析后得到仅含p值的相关矩阵，用它绘制只展示显著p值（<0.05）的相关图时，对角线出现问号，已知是因为矩阵对角线为NA导致的，请问怎么让corrplot忽略这些NA？

原绘图代码：

corrplot(data_corr$P, order = "hclust", type = "upper",
         tl.col = "black", tl.srt = 45,  sig.level=0.05, tl.cex = 0.3)

两种解决方法 #

方法一：直接隐藏对角线元素 #

在corrplot()函数中添加diag = FALSE参数，直接跳过对角线元素的绘制，彻底消除问号：

corrplot(data_corr$P, order = "hclust", type = "upper",
         tl.col = "black", tl.srt = 45, sig.level=0.05, 
         tl.cex = 0.3, diag = FALSE)

方法二：替换对角线的NA值 #

如果不想隐藏对角线，可以把矩阵对角线的NA替换为1（p=1远大于0.05，不会被标记为显著，也不会显示异常符号），再进行绘图：

# 复制p值矩阵
p_matrix <- data_corr$P
# 将对角线的NA替换为1
diag(p_matrix) <- 1
# 使用修改后的矩阵绘图
corrplot(p_matrix, order = "hclust", type = "upper",
         tl.col = "black", tl.srt = 45, sig.level=0.05, 
         tl.cex = 0.3)

两种方法都能解决对角线问号的问题，按需选择即可。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Afia A