R中BIOMOD_ModelingOptions()函数参数错误的原因是什么？

问题背景 #

我一直用R代码基于大西洋森林小型哺乳动物的出现记录和环境变量预测值，预测它们的未来分布。去年代码运行完全正常，但现在出现如下错误：

Error in BIOMOD_ModelingOptions(MAXENT.Phillips = list(path_to_maxent.jar = "C:/Users/Isabella/Documents/R/library/dismo/java", :
unused argument (MAXENT.Phillips = list(path_to_maxent.jar = "C:/Users/Isabella/Documents/R/library/dismo/java", memory_allocated = NULL, maximumiterations = 500, linear = T, quadratic = T, product = F, threshold = F, hinge = F, lq2lqptthreshold = 80, l2lqthreshold = 10, hingethreshold = 15, beta_threshold = -1, beta_categorical = -1, beta_lqp = -1, beta_hinge = -1, betamultiplier = 0.5, defaultprevalence = 0.5))

起初以为是path_to_maxent.jar路径问题，修改后发现路径正确。同事在非Windows电脑上运行相同代码无错误，我已更新R及所有R包，问题仍未解决。

问题原因与解决方案 #

这个错误的核心是BIOMOD2包版本更新后，MaxEnt相关参数的命名规则发生了变化：旧版本中使用MAXENT.Phillips作为参数名调用模型，但新版本里该参数名已改为Maxent（注意大小写差异）。

具体解决步骤：

• 直接将代码中的MAXENT.Phillips替换为Maxent
• 确认path_to_maxent.jar路径无误（你已验证过路径，可跳过此步骤）

修改后的代码示例：

BIOMOD_ModelingOptions(
  Maxent = list(
    path_to_maxent.jar = "C:/Users/Isabella/Documents/R/library/dismo/java",
    memory_allocated = NULL,
    maximumiterations = 500,
    linear = T,
    quadratic = T,
    product = F,
    threshold = F,
    hinge = F,
    lq2lqptthreshold = 80,
    l2lqthreshold = 10,
    hingethreshold = 15,
    beta_threshold = -1,
    beta_categorical = -1,
    beta_lqp = -1,
    beta_hinge = -1,
    betamultiplier = 0.5,
    defaultprevalence = 0.5
  )
)

同事的非Windows电脑未报错，大概率是因为她的BIOMOD2版本仍停留在旧版，或已提前适配新参数名；而你更新后使用了新版BIOMOD2，必须修改参数名才能正常运行。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Isabella Bento