Nextflow中channel.FromPath返回null报错，文件存在如何解决？

核心错误原因 #

你代码里的channel.FromPath写法错误，Nextflow中创建文件通道的正确方法是小写开头的fromPath，大写的FromPath不是合法方法，会返回null，因此调用view()时触发Cannot invoke method view() on null object错误。

修正后的代码 #

nextflow.enable.dsl=1
channel.fromPath('/cluster/projects/p33/users/gledak/metabolomics/lipids/out/*_permuted*.glm.linear').view()

额外排查点（如果修正后仍有问题） #

• 确认路径通配符是否匹配到文件：可以在终端执行ls /cluster/projects/p33/users/gledak/metabolomics/lipids/out/*_permuted*.glm.linear，看是否能列出目标文件
• 检查路径是否有拼写错误，Linux系统路径区分大小写，注意目录名、文件名的大小写是否一致
• 若使用DSL2，也可以用path工厂方法创建通道，写法为path('/cluster/projects/p33/users/gledak/metabolomics/lipids/out/*_permuted*.glm.linear').view()

内容的提问来源于stack exchange，提问作者zillur rahman