Conda环境加载R包terra报错：找不到libproj.so.15求解决

核心原因 #

r-data.table和r-terra依赖的libproj库版本不匹配：r-terra 1.5_21需要libproj.so.15（对应proj 8.x版本），而r-data.table 1.14.8可能拉取了更高版本的proj（如9.x，对应libproj.so.22），导致依赖库被覆盖，触发加载错误。

解决方法 #

1. 完全重建环境（推荐） #

删除现有冲突环境，统一使用conda-forge通道创建，避免跨通道依赖混乱：

• 删除环境：

  mamba remove -n mexico --all
  

• 重新创建环境，仅指定conda-forge为优先通道（bioconda包会自动从conda-forge拉取兼容依赖）：

  mamba create -n mexico -c conda-forge r-base=4.2.3 r-data.table=1.14.8 r-terra=1.5_21
  

2. 修复现有环境 #

若不想重建，可强制重装匹配版本的依赖库：

• 激活环境：

  conda activate mexico
  

• 强制从conda-forge安装r-terra所需的libproj版本及对应r-terra包：

  mamba install -c conda-forge --force-reinstall libproj=8.* r-terra=1.5_21
  

3. 优化通道优先级配置 #

避免后续出现类似冲突，调整conda通道优先级：

• 设置通道顺序（conda-forge优先）：

  conda config --add channels conda-forge
  conda config --add channels bioconda
  conda config --add channels defaults
  

• 开启严格通道优先级：

  conda config --set channel_priority strict
  

额外提示 #

• 安装时r-base缓存异常若未导致环境创建失败，可忽略；若后续出现其他问题，清理缓存后重试：

  mamba clean --all
  

• 加载r-terra时的警告多为版本兼容提示，若不影响功能可忽略。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Gonzalo Rizzo