如何在R语言中去除数据框（dataframe）中的科学计数法

问题原因 #

你遇到的问题核心是：bed_file_position_hic的start和end列里的"1e+06"是字符类型的字符串，而非数值类型。options(scipen=999)和format()仅对数值型数据的显示格式生效，直接处理字符型的科学计数法字符串不会有任何变化。

从你提供的chr9_mod结构能看到，它的行名和列名本身就是字符格式的科学计数法字符串，赋值给数据框列后自然保留了字符类型。

可行解决方法 #

方法1：转换为无科学计数法的字符型 #

先把字符型的科学计数法字符串转为数值，再格式化为普通数字字符串：

# 处理start列
bed_file_position_hic$start <- format(as.numeric(bed_file_position_hic$start), scientific = FALSE)
# 处理end列
bed_file_position_hic$end <- format(as.numeric(bed_file_position_hic$end), scientific = FALSE)

方法2：转为数值型并强制关闭科学计数法显示 #

如果后续需要对这些值做数值运算，推荐转为数值型，同时通过scipen确保显示时不出现科学计数法：

options(scipen = 999) # 全局关闭科学计数法显示
bed_file_position_hic$start <- as.numeric(bed_file_position_hic$start)
bed_file_position_hic$end <- as.numeric(bed_file_position_hic$end)

优化初始赋值步骤（从源头避免问题） #

如果想从一开始就避免字符型科学计数法，可以在提取chr9_mod的行名/列名时直接转换：

options(scipen=999) 
chr9_mod <- chr9[26:3531,26:3531]
bed_file_position_hic <- as.data.frame(matrix(ncol=3,nrow=3506))
colnames(bed_file_position_hic) <- c("chrom","start","end")
j <- 1
k <- 3506
for(i in 1){
  # 提取行名后直接转数值再转字符
  bed_file_position_hic$start[j:k] <- format(as.numeric(rownames(chr9_mod)[i]), scientific = FALSE)
  # 列名同理处理
  bed_file_position_hic$end[j:k] <- format(as.numeric(colnames(chr9_mod)[1:3506]), scientific = FALSE)
  j <- k +1
  k <- k+1+3505
}

内容的提问来源于stack exchange，提问作者rheabedi1