请求将滑液支原体疫苗株MSH纳入ClueGO用于本体与通路映射
添加滑液支原体疫苗株MSH至ClueGO/CluePedia物种列表的解决方案
- 要让ClueGO和CluePedia支持滑液支原体疫苗株MSH,你可以按以下步骤操作:
- 整理核心信息:准备好菌株的完整学名(Mycoplasma synoviae strain MSH)、NCBI分类ID(若已有),以及该菌株已有的功能注释资源(如GO注释、KEGG通路注释文件)。
- 提交官方请求:直接向ClueGO/CluePedia开发团队提出添加申请,可通过两种方式:
- 在项目官方代码托管平台提交issue,清晰说明你的RNA-seq研究需求和菌株详细信息;
- 通过工具官方文档提供的联系邮箱发送申请邮件,附上研究背景和菌株注释材料。
- 临时替代方案:在等待官方处理期间,可手动导入注释文件实现分析:
- 生成该菌株基因ID与GO术语的映射文件;
- 在ClueGO界面选择「Custom」物种选项,上传映射文件后即可开展功能富集分析。
内容的提问来源于stack exchange,提问作者Dan
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