Unix环境下遍历文件夹匹配文件名并重命名的正则表达式问题

需求说明 #

需要遍历/home/directory/下的所有.spart文件，提取每个文件路径中最后一个/和.之间的物种名称，并将原文件内容保存到「原文件名追加_sort」的新文件中（或按需求生成以物种名命名的带_sort后缀的文件）。

待处理文件路径：

/home/directory/escherichia_coli.spart
/home/directory/pseudomonas_aeruginosa.spart
/home/directory/pseudomonas_fluorescens.spart
/home/directory/streptocuccus_agalactiae.spart

原脚本的问题 #

你之前的尝试存在几处语法错误：

• 直接写$i > ...会把文件名当作命令执行，而非读取文件内容
• $i/${i: /$.*\.}_sort.txt是无效路径拼接，$i已包含完整文件名，这样会生成类似/home/directory/xxx.spart/xxx的错误路径
• ${i: /$.*\.}不是bash支持的参数展开语法，bash不支持这种内嵌正则的写法

正确解决方案 #

方法1：用bash内置参数展开（高效无需外部工具） #

如果需求是原文件名后直接追加_sort.txt（比如escherichia_coli.spart → escherichia_coli.spart_sort.txt）：

for file in /home/directory/*.spart; do
    # 生成新文件名：原路径+原文件名+_sort.txt
    new_file="${file}_sort.txt"
    # 复制原文件内容到新文件（如果是重命名原文件，把cp换成mv）
    cp "$file" "$new_file"
done

如果需求是提取物种名，生成物种名_sort.txt（比如escherichia_coli.spart → escherichia_coli_sort.txt）：

for file in /home/directory/*.spart; do
    # 去掉路径前缀，只保留文件名（比如escherichia_coli.spart）
    filename="${file##*/}"
    # 去掉文件名后缀，提取物种名（比如escherichia_coli）
    species="${filename%.*}"
    # 生成新文件名
    new_file="/home/directory/${species}_sort.txt"
    cp "$file" "$new_file"
done

方法2：用正则表达式（sed工具）提取物种名 #

如果偏好正则匹配的方式，可以用sed提取最后一个/和.之间的内容：

for file in /home/directory/*.spart; do
    # 正则匹配提取物种名
    species=$(echo "$file" | sed -E 's/^.*\/(.*)\..*$/\1/')
    # 按需求生成新文件名，示例为物种名+_sort.txt
    new_file="/home/directory/${species}_sort.txt"
    cp "$file" "$new_file"
done

内容的提问来源于stack exchange，提问作者user15853667