使用gtsummary生成汇总表时遇xfun包yaml_body导出错误求助

问题重现 #

执行gtsummary包的汇总表生成代码（如tbl_summary()）时，触发如下错误：

Error: 'yaml_body' is not an exported object from 'namespace:xfun'

原因分析 #

该错误源于xfun包未正确导出yaml_body函数，通常是包版本过旧或安装文件损坏导致的。

解决方案 #

方案1：重装官方稳定版xfun包 #

1. 卸载现有xfun包：

remove.packages("xfun")

2. 安装最新稳定版：

install.packages("xfun")

3. 必须重启R会话，之后重新运行你的代码：

library(gtsummary)
library(tidyverse)

trial2 <- trial %>% select(trt, age, grade, response)
trial2 %>%
  tbl_summary(by = trt) %>%
  add_p()

方案2：安装xfun开发版 #

若方案1无效，尝试安装GitHub上的xfun开发版本：

1. 先安装devtools工具包（未安装时执行）：

install.packages("devtools")

2. 安装开发版xfun：

devtools::install_github("yihui/xfun")

3. 重启R会话后重新运行代码。

额外排查项 #

• 确保所有依赖包（gtsummary、tidyverse等）为最新版本：

update.packages(ask = FALSE)

• 运行代码前避免加载无关包，防止命名空间冲突。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Nick Hollman