如何引用xargs中{}所指代对象/字符串的基名？批量处理.fam文件时的临时文件重命名方法

1. 正确在xargs中访问{}并避免临时文件冲突 #

你原来的命令存在一个核心问题：所有通过xargs处理的文件会共用同一个tmp文件，这会导致文件内容被覆盖，最终只有最后一个文件的处理结果能保留。要让每个文件拥有独立的处理流程，需要把整个命令逻辑放到子shell中执行，确保每一次{}的替换都在独立上下文里完成：

xargs -I {} sh -c 'COMMAND HERE "$1" > "$1.tmp" && mv "$1.tmp" "$1"' _ {}

关键要点：

• 用sh -c包裹整个命令，让每个{}对应一次独立的shell执行
• $1代表传入的文件名（即原来的{}），用双引号包裹能避免文件名含空格、特殊字符的问题
• 临时文件命名为$1.tmp，确保每个文件的临时文件唯一，不会互相覆盖

2. 批量处理.fam文件的正确命令 #

针对你的.fam文件修改需求（将第6列的1改成0，2改成1），不需要两次awk调用，一次awk就能完成所有替换。结合xargs的正确用法，批量处理的命令应该是：

ls *.fam | xargs -I {} sh -c 'awk '\''{gsub("1","0",$6); gsub("2","1",$6)}1'\'' "$1" > "$1.tmp" && mv "$1.tmp" "$1"' _ {}

如果要避免ls命令在处理特殊文件名（比如含换行）时的潜在问题，更稳妥的方式是用find替代：

find . -maxdepth 1 -type f -name "*.fam" | xargs -I {} sh -c 'awk '\''{gsub("1","0",$6); gsub("2","1",$6)}1'\'' "$1" > "$1.tmp" && mv "$1.tmp" "$1"' _ {}

补充说明：

• 合并两次awk调用为一次，提升处理效率：awk '{gsub("1","0",$6); gsub("2","1",$6)}1'，其中1是awk的惯用写法，用于打印所有处理后的行
• 用sh -c确保每个文件的处理流程独立，彻底避免临时文件冲突
• 双引号包裹$1，兼容带空格的特殊文件名

3. 引用xargs中{}的基名 #

如果需要获取{}对应的文件名（不含路径），可以用basename命令实现。比如你想把处理后的文件放到指定目录，只保留原文件的基名：

find /path/to/fams -name "*.fam" | xargs -I {} sh -c '
  base=$(basename "$1")
  awk '\''{gsub("1","0",$6); gsub("2","1",$6)}1'\'' "$1" > "/path/to/output/$base"
' _ {}

这里base=$(basename "$1")就提取了{}的基名（例如/a/b/file.fam会被处理成file.fam）。如果需要去掉文件后缀（比如得到file），可以用basename "$1" .fam实现。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Sky Scraper