如何在R绘图中平滑曲线？已试lowess但不知如何集成代码

从你的代码来看，你应该是在绘制vegan包的物种累积曲线（accumresult对象）。要添加lowess平滑线，需要先提取曲线的原始数据，拟合平滑模型后再叠加到图上，具体步骤如下：

步骤1：提取累积曲线的数值 #

先从你的累积结果对象中取出横轴（样本数量）和纵轴（物种数量）的数据：

# 提取第一条曲线的x、y值
x1 <- PA_Spe_accum$x
y1 <- PA_Spe_accum$y

# 提取第二条曲线的x、y值
x2 <- PA_Spe2_accum$x
y2 <- PA_Spe2_accum$y

步骤2：用lowess拟合平滑曲线 #

使用lowess()函数拟合，核心参数f控制平滑程度（取值0-1，值越大曲线越平滑），这里以f=0.3为例：

# 拟合第一条曲线的平滑模型
fit1 <- lowess(x1, y1, f = 0.3)
# 拟合第二条曲线的平滑模型
fit2 <- lowess(x2, y2, f = 0.3)

步骤3：叠加平滑线到原有绘图 #

先运行你原来的绘图代码，再用lines()把平滑线加上：

# 原有绘图代码（保留置信区间）
plot(PA_Spe_accum, ci = 1.96, ci.type = "bar", las=1, col = "green3", lty = 1, lwd=2, ci.col = "green3", ci.lty = 1, xlim=c(0,60), ylim=c(0,70))
plot(PA_Spe2_accum, add = TRUE, ci = 1.96, ci.type = 'bar', lwd=2, col = 'royalblue4', lty = 1, ci.col = 'royalblue4', ci.lty = 1)

# 添加lowess平滑线，用不同线型区分原始曲线和平滑线
lines(fit1, col = "darkgreen", lwd = 2, lty = 2)
lines(fit2, col = "darkblue", lwd = 2, lty = 2)

额外调整建议 #

• 如果你觉得平滑效果不合适，可以修改lowess()中的f参数：比如f=0.5会更平滑，f=0.1会更贴近原始数据。
• 若要显示原始数据点，可以在plot()命令中添加pch=16（实心点）或其他点样式参数。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Anna-Sofie