rmarkdown::render无法渲染图表，但Knit按钮可正常渲染

1. 对齐工作目录 #

手动点击Knit时，RStudio会自动将工作目录切换到Rmd文件所在路径；但R脚本调用rmarkdown::render()时，工作目录可能是脚本的运行路径（即便脚本和Rmd在同文件夹，也可能因运行方式出现差异）。

• 解决方法：在调用render前显式指定Rmd所在路径，或切换工作目录：

  # 方式1：切换到Rmd所在目录
  setwd(dirname("test2_default.Rmd"))
  rmarkdown::render("test2_default.Rmd")
  
  # 方式2：使用绝对路径调用Rmd
  rmarkdown::render(file.path(getwd(), "test2_default.Rmd"))
  

2. 统一图形设备配置 #

手动Knit和脚本调用时的默认图形设备可能不同，Word需要支持嵌入的图形格式（如PNG、EMF）。

• 解决方法：在render函数中指定图形设备，或在Rmd的YAML头中配置：

  # 在render函数中指定设备
  rmarkdown::render("test2_default.Rmd", output_options = list(dev = "png"))
  

  或者在Rmd的YAML区域添加配置：

  ---
  output:
    word_document:
      dev: png
  ---
  

3. 检查包版本兼容性 #

R 4.1版本相对老旧，可能存在rmarkdown、knitr或图形相关包（如grDevices）的版本兼容问题。

• 解决方法：更新兼容R 4.1的最新稳定版包：

  update.packages(c("rmarkdown", "knitr", "grDevices"))
  

4. 确认临时文件权限 #

脚本调用时，临时生成的图形文件可能因权限问题无法被Word读取嵌入。

• 解决方法：指定可读写的输出和临时文件目录：

  # 确保output和temp目录已创建
  dir.create("./output", showWarnings = FALSE)
  dir.create("./temp", showWarnings = FALSE)
  
  rmarkdown::render("test2_default.Rmd", output_dir = "./output", intermediates_dir = "./temp")
  

5. 检查Rmd代码块设置 #

确认生成pressure图表的代码块没有异常配置，比如错误的fig.path路径：

• 正确代码块示例：

  ```{r pressure-plot}
  plot(pressure)
  

内容的提问来源于stack exchange，提问作者oli987654