C语言MPI程序在Cygwin中mpirun运行报错求助

问题描述 #

在Cygwin控制台环境下编译C语言MPI Hello World程序，使用mpicc file.c -o file编译无报错，但执行mpirun -np 2 ./file时出现以下错误：

[DESKTOP-3F9P53V:01959] [[INVALID],INVALID] FORCE-TERMINATE AT Not found:-13 - error /pub/devel/openmpi/v4.0/openmpi-4.1.5-1.x86_64/src/openmpi-4.1.5/orte/mca/plm/rsh/plm_rsh_component.c(335)

当前配置：

• 已安装Cygwin相关包（见附图）
• 已下载MinGW并添加至用户环境变量
• Cygwin的bin目录已添加至环境变量

解决步骤 #

1. 安装rsh/SSH相关依赖包 #

错误提示来自OpenMPI的rsh组件，说明Cygwin缺少远程登录相关工具，需安装以下包：

• rsh
• rsh-server
• openssh

打开Cygwin的setup.exe，搜索上述包并选择安装，完成后重启Cygwin终端。

2. 配置本地SSH免密登录 #

OpenMPI需要无密码访问本地节点来启动进程，执行以下步骤：

1. 在Cygwin终端生成SSH密钥：

   ssh-keygen -t rsa -N "" -f ~/.ssh/id_rsa
   

2. 将公钥添加到授权列表：

   cat ~/.ssh/id_rsa.pub >> ~/.ssh/authorized_keys
   chmod 600 ~/.ssh/authorized_keys
   chmod 700 ~/.ssh
   

3. 测试本地SSH登录：

   ssh localhost
   

   确保无需输入密码即可登录，若成功则退出登录。

3. 指定OpenMPI进程启动代理 #

运行程序时，显式指定使用SSH作为进程启动代理：

mpirun --mca plm rsh --mca plm_rsh_agent ssh -np 2 ./file

或者使用isolated模式（仅适用于单节点测试）：

mpirun --mca plm isolated -np 2 ./file

4. 排查环境变量冲突 #

由于同时配置了MinGW和Cygwin，可能存在工具链冲突：

• 确保Cygwin的bin目录在环境变量中的优先级高于MinGW的目录
• 或者在Cygwin终端中临时移除MinGW的环境变量，再运行MPI程序

5. 验证OpenMPI包完整性 #

确认已安装完整的OpenMPI组件：

• openmpi（核心运行库）
• openmpi-devel（开发头文件和编译工具）
• openmpi-libs（依赖库）

若缺失，通过Cygwin setup.exe补充安装，避免仅安装部分组件导致的运行错误。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者dacian